natürlich kannst du eine der Partitionen formatieren.
Jedoch nur auf der Systempartition meist C: befindet sich der Bootbereich für beide BS.
Solltest du diese formatieren wollen, musst du anschließend den Bootbereich reparieren.
Boote von der Xp-Cd -> drücke die Taste R um Windows mit der Wiederherstellungskonsole zu reparieren -> wähle die vorhanden Xp Installation aus und gebe nach Aufforderung dein Administratorpasswort ein. Gebe folgende Befehle ein und bestätige diese jeweils mit Enter:
fixmbr c:\ -> Enter
fixboot c:\ -> Enter